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所谓冻干机的自动控制应该包括二个部分，一是冻干机的各设备按冻干工艺要求在规定的时间自动走停，二是冻干箱板层温度按冻干曲线要求自动跟踪，整个冻干进程不需要人工操作，当然如果需要也可进行人工干预。但有些冻干机的自动控制是不完全的，仅能自动跟踪冻干曲线，其余部分需人工操作。
有些冻干机的自动控制仅能到冻干结束，冻干结束之后的箱内压塞、冷凝器除霜以及蒸汽消毒不能自动进行，需要人工操作，特别是蒸汽消毒部分，因涉及到许多阀门控制，人工操作比较麻烦，应该选择自动消毒程序的冻干机。
有些冻干机的自动控制是使用微机，操作、编程方便，显示的语言是冻干语言，还带有荧光屏，打印机和软盘，能同时储存几十个冻程序，每个程序内容可显示，整个程序内容可由打印机打出。而有冻干机的自动控制使用的是一种仪表，操作、编程均较麻烦，可储存的冻干程序也较少。
记录仪表对冻干机来说也是一个很重要的仪器，它能把整个冻干的实际过空地记录下来，以便日后存查，记录仪表大都采用多点记录仪，它既能打点，又能直接进行文字记录，还有数字显示系统。
冻干原理
一、汽化与升华
物质从液相变为气相的过程叫做汽化。对于水来说，如环境温度大于0℃、水汽分压小于水的饱和蒸汽压，则汽化能顺利进行。目前大多数干燥方法都是照此原理进行工作。
物质从固相变为气相的过程叫做升华。如果环境温度小于0℃，水以固态冰的形式存在，环境中水汽分压小于冰表面的水饱和蒸汽压，则升华能顺利进行。如此时环境中水汽分压大于冰表面的水饱和蒸汽压，则水汽凝结成冰或霜，我们称此为凝华，它是升华的相反过程。
二、冻干现象
人们普遍的概念，清洗衣料后，衣料干燥应在较高的温度、通风干燥的环境下进行，环境温度越高、空气干燥度越高，则衣料干得越快。可在严寒地区，人们发现洗过的衣料，凉在始终冰雪不化的背阳处，冻成硬梆梆的衣料也会干燥。另外人们也发现放在冷库、冰箱冷冻室中未包装的食品，虽然冻得很硬，但表面已经干燥，这些就是冻干现象。
三、冻干原理及定义
我们知道，当温度为0℃时，水刚好处于冰点，此时水处于液、气、固三态并存，我们把此点叫做水的三相点。温度向上，水以汽、液二相出现；温度向下、水以汽、固二相形态出现。
当水冻结成冰后，从前面的学习中我们知道，只要环境中的水汽分压小于对应温度冰的饱和蒸汽压，则冰直接从固态变为汽态而进行干燥过程，我们把这一过程叫做升华干燥，冰直接从固态变为汽态的现象叫升华。我们把物料在冻结的情况下进行干燥，在干燥过程中冰不溶化，冰从固态直接汽化而干燥的过程叫冷冻干燥（简称冻干）。
四、恒迈冻干机
利用真空冷冻干燥原理制造，结构合理，维护方便、费用低廉，全自动控制、操作方便；具有冻干曲线自整定、显示记录各参数功能，工作状态一目了然，不必为冻干曲线的设定而烦恼；操作人员仅需按钮开机，根据指示灯出料即可；功能周全，速冻、冻干一次完成，*配套设施（如蒸汽锅炉、空压泵等等），通上电源便可工作；的环境适应能力，在40℃的高温下能照常运行；设计*特，运行周期短，能耗较低，使低价格物料的冻干有利可图。
恒迈冻干机与其他冻干机相比，同样处理能力的设备，其功率配备仅为二分之一或更低。干燥时间短，一般为8—16小时（视物料的性质而定）。相比之下节能效果明显、实在。

预冻干燥在原位进行，减少干燥过程的繁琐操作，实现了冻干过程的自动化；
硅油作为循环介质，控温精度高，搁板温差≤1℃,干燥效果均匀；
可选配，进口INFICON皮拉尼规管。
可选配，进口爱德华真空泵。
搁板温度可调、可控、可摸索、中试和生产工艺；
可储存20个程序，每个程序可设36段，冷冻干燥机在运行过程中可修改程序参数，并记录后的干燥曲线；
触摸屏操作，PID控制，显示干燥曲线；
方形托盘不易变形，易于操作，便于清洗；
配置充气阀，可充干燥惰性气体；
干燥室采用高透光无色透明**玻璃门，在操作过程中能清晰观察物料的变化过程；

冷冻干燥有下列优点:
一．冷冻干燥在低温下进行,因此对于许多热敏性的物质特别适用.如蛋白质、微生物之类不会发生变性或失去生物活力.因此在医药上得到广泛地应用.
二．在低温下干燥时,物质中的一些挥发性成分损失很小,适合一些化学产品,药品和食品干燥.
三．在冷冻干燥过程中,微生物的生长和酶的作用无法进行,因此能保持原来的性装.
四．由于在冻结的状态下进行干燥,因此体积几乎不变,保持了原来的结构,不会发生浓缩现象.
五．干燥后的物质疏松多孔,呈海绵状,加水后溶解迅速而完全,几乎立即恢复原来的性状.
六．由于干燥在真空下进行,氧气较少,因此一些易氧化的物质得到了保护.
七．干燥能排除95-99%以上的水份,使干燥后产品能长期保存而不致变质.
因此,冷冻干燥目前在医药工业,食品工业,科研和其他部门得到广泛的应用.

连续式冻干设备
近年来，国内外开始探索和使用连续式真空冷冻干燥设备。连续式设备的特点是适于品种单一而产量庞大、原料充足的产品生产，特别适合浆状和颗粒状制品的生产。连续式设备容易实现自动化控制，简化了人工操作和管理，其主要缺点是成本高。
随着GMP认证的结束，国产的优秀医药用冻干设备全面进入了现代化阶段，功能齐全、工作可靠、性能稳定，可实现在线清洗（CIP）或蒸汽消毒灭菌（SIP），各项技术指标都能满足生物制品和药品冻干生产的需要。相比之下，国外冻干设备的品种规格比国内多，配套设备齐全，节能型结构比较精致，连续式冻干设备生产量大。为保证冻干产品的质量和节能，常采用冻干设备与其它干燥设备组合在一起的组合冻干设备，例如喷雾冻干设备。
在未来，如何在保证产品质量的前提下，提高冷冻干燥效率，缩短干燥时间，节约能源将是广大冻干行业工作者的目标。